Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms