Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX1P48742 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX1P48742 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms