Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GGCXP38435 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms