Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms