Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA10P31260 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms