Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PTPRMP28827 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRMP28827 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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