Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EPCAMP16422 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms