Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CSRP3-202ENST00000533783 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms