Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms