Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CFAP73A6NFT4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CFAP73A6NFT4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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