Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms