Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms