Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2orf88Q9BSF0 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms