Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF34Q969K3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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