Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PHF3Q92576 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PHF3Q92576 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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