Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms