Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTN4Q8IWV2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTN4Q8IWV2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms