Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC149Q6ZUS6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms