Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DUX4L9Q6RFH8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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