Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRAMD4Q6IC98 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GRAMD4Q6IC98 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms