Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms