Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PRAMEF20Q5VT98 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms