Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms