Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms