Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKOR2Q2VWA4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKOR2Q2VWA4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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