Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTC1Q2NKJ3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms