Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms