Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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