Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
USF2Q15853 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
USF2Q15853 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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