Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IRF4Q15306 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IRF4Q15306 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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