Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOFQ13790 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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APOFQ13790 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOFQ13790 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOFQ13790 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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