Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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