Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C1orf61Q13536 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms