Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RLFQ13129 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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