Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GRIK2Q13002 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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