Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms