Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERVPABLB-1P60509 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms