Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK8P49336 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK8P49336 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms