Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFC1P35251 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFC1P35251 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFC1P35251 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms