Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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