Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB4P28070 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms