Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2AP24928 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms