Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XBP1P17861 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XBP1P17861 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XBP1P17861 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XBP1P17861 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XBP1P17861 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XBP1P17861 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms