Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA1P17302 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms