Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF4P15884 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCF4P15884 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms