Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM228BP0C875 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms