Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGGP02679 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGGP02679 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGGP02679 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms