Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJB6O95452 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJB6O95452 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms