Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTN3O95197 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RTN3O95197 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RTN3O95197 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTN3O95197 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RTN3O95197 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RTN3O95197 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RTN3O95197 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTN3O95197 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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