Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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